De prevalentie van voedselallergie bij kinderen tot 3 jaar is 4-8% [3]; [15]. Prevalentiecijfers zijn echter afhankelijk van de onderzoeksmethode. Zelfrapportage van symptomen geeft een veel hogere prevalentie vergeleken met onderzoek waarbij ook sensibilisatie (serum IgE) en/of dubbelblind placebogecontroleerde voedselprovocatie wordt betrokken [22]. Er lijkt geen toename van de prevalentie van voedselallergie in de tijd te zijn, maar meer onderzoek is nodig om hier duidelijkheid over te krijgen [151].
Kinderen met voedselallergie hebben over het algemeen 2-4 keer meer kans op andere atopische aandoeningen zoals astma (4,0 keer) en atopische dermatitis (2,4 keer) vergeleken met kinderen zonder voedselallergie [22].